在飞騨国分寺的正殿和钟楼门之间，矗立着一颗树龄超过1200年的著名大银杏。这棵大银杏高约27米，为雄株，枝叶茂密，时至今日依然枝叶繁茂。

关于这棵大银杏，还流传着悲伤的故事。据说当年在国分寺塔遗址上建造七重塔时，木匠师傅搞错了横梁柱子的尺寸，他的女儿告诉了他在柱子上面设置斗拱来补救的办法，之后女儿选择用自尽来埋葬这个秘密。而作为墓碑种在那里的，便是国分寺的这棵大银杏树。

此外，很久以前就流传着国分寺的银杏叶落下便会下雪的说法。