国分寺由行基和尚创建于公元746年，是该地区的第一古刹。正殿建于室町时代中期，其建筑风格充分体现了飞騨木匠的精湛技艺。

正殿中安放着木鹤大明神像，他是在木雕和机械装置方面技艺超群的平安时代名匠。另外还有首位获得受领名（非正式的官名）和飞騨权守地位的飞騨木匠藤原宗安的雕塑像。

寺内还相连矗立着一颗树龄超过1200年的大银杏树（国家指定天然纪念物）和白木结构的三重塔，随四季的变换展现出景色各异的风貌。