飛驒國分寺位於高山市總和町，有大銀杏樹與三重塔聳立其中。寺廟範圍內有鐘樓門等建築，據說是從高山城移置過來的。

室町時代建造的正殿是日本國家的重要文化財產，正殿的東側有用玉垣（神社柵欄）圍起來的塔心礎石。飛驒國分寺據說是天平13年（西元741年）奉詔建造，於天平勝寶9年（西元757年）左右完成，此座塔心礎石據推測應是創建當時之物。礎石的形狀大致上是方形，於其上方建造圓形柱座，即為中央部分開圓形孔洞的「卯眼式塔心礎石」。石質是當地稱為「松倉石」的流紋岩。

確認古代國分寺與國分尼寺金堂的存在，對探究奈良時代的飛驒歷史有極大的貢獻。