近代飛驒的寺廟建築基本上都是日本傳統和式建築，像是柱子上的抖拱等，可以看得出來與其他地區不同，具有自己的獨特性。

這個時代出現很多世世代代從事木工工作的家族，將飛驒木匠的技術就此傳承。其中，從江戶時代中期以後，歷經四代都以「水間相模守」為名，以優秀的雕刻為特徵的水間一門，被認為是以「飛驒木匠的祖師」之名倍受尊崇的飛驒權守藤原宗安的直系後代。由第三代水間相模守建造的國分寺三重塔，就在高山市中心。


現在的三重塔，是寬政3年（西元1791年）被大風吹倒31年之後，藉由一般人民的捐款800兩，以及5500名木工之手所建造，文政4年（西元1821年）才終於竣工。

國分寺三重塔是飛驒唯一的塔式建築，安置了真言密宗教主之金剛界、胎藏界的大日如來，是岐阜縣的重要文代財產。